期刊简介

               本刊为全国一类中医学术性期刊,以报道本院教育、科研成果和临床经验为主,兼顾本省及国内外有学术见解的优秀中医学论文,以提高为主兼顾指导自学。                

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  • 杂志名称:浙江中医药大学学报杂志
  • 主管单位:浙江中医药大学
  • 主办单位:浙江中医药大学
  • 国际刊号:1005-5509
  • 国内刊号:33-1349/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:1989年获浙江省高校学报编辑质量三等奖期刊收录:国家图书馆馆藏, 上海图书馆馆藏, 哥白尼索引(波兰), 维普收录(中), 万方收录(中), CA 化学文摘(美), 知网收录(中)
浙江中医药大学学报杂志2012年第04期

生物基因与蛋白质序列比对算法的图形硬件加速研究

冯梦蝶;张林;柴惠

关键词:生物分子, 序列比对, 动态规划算法, 图形硬件
摘要:[目的]探索准确、高效、低成本、通用性并存的生物序列比对方法.[方法]将点阵图算法、启发式算法等各种序列比对算法中准确性高的动态规划算法予以在计算机中实现,并通过流模型将其映射到图形硬件上以实现算法加速,通过数据库比对搜索实例进行比对时间和每秒百万次格点更新(MCUPS)性能值评测.[结果]与目前快的启发式算法相比,该加速算法比对平均加速为18倍,高加速可达28倍.[结论]该加速算法在保证此对准确性的同时,能较大地提高比对速度.